根据上述主要职责，上海市司法局设11个职能处（室）和政治部（副局级），即：办公室（外事办公室）、监狱劳教政策研究室、法制宣传处（依法治理工作指导处）、律师工作管理处、公证工作管理处、基层工作处（安置帮教工作指导处）、司法鉴定管理处、执业监督处、法制处、计划财务处（技术装备处）、审计处、政治部。政治部内含组织处、干部处、宣传教育处、人事警务处（老干部处）。另按有关规定设置纪检监察机构和机关党委。

　　其中，监察室为市监察委员会的派出机构，与局纪委合署办公。市法制宣传教育领导小组办公室、市人民调解工作指导委员会办公室、市刑释解教人员安置帮教工作协调小组办公室、市司法鉴定工作委员会办公室均设在市司法局。市司法局直属单位有市监狱管理局、市劳动教养管理局、市政法管理干部学院（上海大学法学院）、市司法学校（司法干校）、上海司法会堂、市法律援助中心、市司法鉴定中心、上海法律人才交流中心、市公证处及41家直属律师事务所。另有市律师协会、市公证员协会、市人民调解协会，代管市法学会。本市19个区县均设立司法局。